Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSPP15924 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSPP15924 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSPP15924 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSPP15924 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSPP15924 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSPP15924 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSPP15924 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSPP15924 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSPP15924 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSPP15924 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms