Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF35P13682 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms