Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD8BP10966 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD8BP10966 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD8BP10966 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD8BP10966 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD8BP10966 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD8BP10966 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD8BP10966 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD8BP10966 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD8BP10966 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD8BP10966 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD8BP10966 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD8BP10966 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD8BP10966 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms