Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VSIG8P0DPA2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms