Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIL1P09327 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIL1P09327 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIL1P09327 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VIL1P09327 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
VIL1P09327 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VIL1P09327 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VIL1P09327 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VIL1P09327 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VIL1P09327 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms