Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAA1P09110 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms