Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFLP07196 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFLP07196 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEFLP07196 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms