Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TULP3O75386 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TULP3O75386 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TULP3O75386 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms