Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPFIA3O75145 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms