Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms