Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL13O43927 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms