Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCEO43556 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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SGCEO43556 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCEO43556 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCEO43556 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGCEO43556 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCEO43556 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCEO43556 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SGCEO43556 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCEO43556 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCEO43556 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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