Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COCHO43405 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COCHO43405 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COCHO43405 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COCHO43405 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COCHO43405 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COCHO43405 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COCHO43405 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COCHO43405 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COCHO43405 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
COCHO43405 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COCHO43405 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COCHO43405 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COCHO43405 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms