Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF3O43395 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms