Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VGFO15240 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VGFO15240 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VGFO15240 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VGFO15240 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VGFO15240 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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