Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYNJ2O15056 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms