Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLGNO14967 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLGNO14967 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms