Protein–RNA interactions for Protein: O00560

SDCBP, Syntenin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBPO00560 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDCBPO00560 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms