Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP9YO00507 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
USP9YO00507 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP9YO00507 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP9YO00507 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP9YO00507 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms