Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAP23O00161 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms