Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B4DXG7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B4DXG7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B4DXG7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B4DXG7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms