Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDR42E2A6NKP2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms