Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
C9orf92A6NGG3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms