Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF316A6NFI3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF316A6NFI3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms