Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C5orf51A6NDU8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C5orf51A6NDU8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms