Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF22A3QJZ6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms