Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A4Q9Y6R1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms