Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms