Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms