Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP3Q9Y2W7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms