Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SBNO2Q9Y2G9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms