Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms