Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMPQ9Y244 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms