Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HDAC5Q9UQL6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms