Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVW-1Q9UQF0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms