Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms