Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO3Q9UK99 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms