Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DCTN4Q9UJW0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCTN4Q9UJW0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms