Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VTI1BQ9UEU0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms