Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN8Q9UBY8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLN8Q9UBY8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms