Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C6orf48Q9UBA6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C6orf48Q9UBA6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C6orf48Q9UBA6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C6orf48Q9UBA6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C6orf48Q9UBA6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C6orf48Q9UBA6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C6orf48Q9UBA6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C6orf48Q9UBA6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C6orf48Q9UBA6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C6orf48Q9UBA6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C6orf48Q9UBA6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms