Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23BQ9NYZ1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23BQ9NYZ1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms