Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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HOXC10Q9NYD6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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HOXC10Q9NYD6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC10Q9NYD6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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HOXC10Q9NYD6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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HOXC10Q9NYD6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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HOXC10Q9NYD6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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HOXC10Q9NYD6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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HOXC10Q9NYD6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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HOXC10Q9NYD6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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