Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms