Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms