Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOXD4L1Q9NU39 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L1Q9NU39 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms