Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBP3Q9NS15 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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