Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC2Q9NRP2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms