Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IL1RAPQ9NPH3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms