Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A4GALTQ9NPC4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A4GALTQ9NPC4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms